通州最初为长江口海域中几块相邻的沙洲,南北朝中期露出水面,至唐朝末年与大陆接壤。
五代时称静海镇,后周显德五年(公元958年)设立通州,属扬州管辖,下辖静海县和海门县。
于2009年经国务院批准,成为南通市通州区。