巴里坤县,全称巴里坤哈萨克自治县,位于新疆维吾尔自治区东部,天山东段北麓,南隔巴里坤山与哈密市为邻,县城巴里坤镇距乌鲁木齐市公路里程570千米。东界伊吾县,西接木垒哈萨克自治,北与蒙古国接壤。全县总面积37303.79平方千米。
巴里坤县地势南高北低,西高东低,西部、南部为天山山脉,中部为北天山及丘陵山区,由西向东倾斜形成起伏不平的波浪式谷地,东部、北部为平原地区。水资源主要来自冰川融水和山间泉水。属温带大陆性干旱气候,气温变化剧烈,南北气候差异明显,降水量分布极不均匀,年均气温3.6℃,年均降水89毫米。